Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GATMP50440 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GATMP50440 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GATMP50440 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GATMP50440 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GATMP50440 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GATMP50440 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GATMP50440 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GATMP50440 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GATMP50440 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GATMP50440 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GATMP50440 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GATMP50440 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GATMP50440 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GATMP50440 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GATMP50440 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GATMP50440 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GATMP50440 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GATMP50440 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GATMP50440 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GATMP50440 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GATMP50440 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GATMP50440 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GATMP50440 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GATMP50440 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GATMP50440 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GATMP50440 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GATMP50440 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GATMP50440 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GATMP50440 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GATMP50440 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GATMP50440 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GATMP50440 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GATMP50440 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GATMP50440 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GATMP50440 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GATMP50440 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GATMP50440 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GATMP50440 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GATMP50440 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GATMP50440 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GATMP50440 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GATMP50440 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GATMP50440 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GATMP50440 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GATMP50440 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GATMP50440 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GATMP50440 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GATMP50440 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GATMP50440 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GATMP50440 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GATMP50440 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GATMP50440 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GATMP50440 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GATMP50440 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GATMP50440 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GATMP50440 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GATMP50440 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GATMP50440 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GATMP50440 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GATMP50440 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GATMP50440 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GATMP50440 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GATMP50440 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GATMP50440 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GATMP50440 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GATMP50440 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GATMP50440 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
GATMP50440 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GATMP50440 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GATMP50440 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GATMP50440 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GATMP50440 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GATMP50440 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GATMP50440 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GATMP50440 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GATMP50440 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GATMP50440 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GATMP50440 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GATMP50440 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GATMP50440 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GATMP50440 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GATMP50440 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GATMP50440 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GATMP50440 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GATMP50440 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GATMP50440 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GATMP50440 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GATMP50440 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GATMP50440 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GATMP50440 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GATMP50440 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GATMP50440 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GATMP50440 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GATMP50440 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GATMP50440 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GATMP50440 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GATMP50440 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GATMP50440 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GATMP50440 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms