Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYB561P49447 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYB561P49447 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CYB561P49447 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYB561P49447 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYB561P49447 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYB561P49447 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYB561P49447 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYB561P49447 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYB561P49447 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYB561P49447 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYB561P49447 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYB561P49447 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYB561P49447 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYB561P49447 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYB561P49447 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYB561P49447 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYB561P49447 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYB561P49447 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYB561P49447 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYB561P49447 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYB561P49447 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CYB561P49447 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYB561P49447 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYB561P49447 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYB561P49447 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYB561P49447 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYB561P49447 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYB561P49447 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CYB561P49447 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYB561P49447 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYB561P49447 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYB561P49447 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYB561P49447 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYB561P49447 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYB561P49447 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYB561P49447 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYB561P49447 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYB561P49447 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYB561P49447 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CYB561P49447 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYB561P49447 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYB561P49447 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYB561P49447 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYB561P49447 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYB561P49447 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYB561P49447 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYB561P49447 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYB561P49447 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYB561P49447 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYB561P49447 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYB561P49447 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYB561P49447 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYB561P49447 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYB561P49447 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYB561P49447 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYB561P49447 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYB561P49447 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYB561P49447 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CYB561P49447 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYB561P49447 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYB561P49447 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYB561P49447 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYB561P49447 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYB561P49447 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYB561P49447 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYB561P49447 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYB561P49447 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYB561P49447 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYB561P49447 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYB561P49447 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYB561P49447 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYB561P49447 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYB561P49447 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYB561P49447 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYB561P49447 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYB561P49447 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYB561P49447 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYB561P49447 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYB561P49447 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYB561P49447 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYB561P49447 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYB561P49447 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYB561P49447 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYB561P49447 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYB561P49447 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYB561P49447 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYB561P49447 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms