Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCLMP48507 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GCLMP48507 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCLMP48507 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GCLMP48507 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCLMP48507 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCLMP48507 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GCLMP48507 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCLMP48507 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCLMP48507 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCLMP48507 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GCLMP48507 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLMP48507 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLMP48507 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLMP48507 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLMP48507 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLMP48507 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GCLMP48507 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLMP48507 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLMP48507 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLMP48507 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLMP48507 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLMP48507 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLMP48507 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GCLMP48507 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCLMP48507 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GCLMP48507 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLMP48507 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLMP48507 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLMP48507 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLMP48507 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLMP48507 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLMP48507 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLMP48507 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GCLMP48507 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLMP48507 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLMP48507 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLMP48507 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLMP48507 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLMP48507 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLMP48507 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GCLMP48507 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GCLMP48507 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCLMP48507 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCLMP48507 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCLMP48507 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCLMP48507 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GCLMP48507 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLMP48507 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLMP48507 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLMP48507 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLMP48507 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLMP48507 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLMP48507 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLMP48507 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GCLMP48507 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCLMP48507 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCLMP48507 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GCLMP48507 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLMP48507 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLMP48507 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLMP48507 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLMP48507 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLMP48507 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLMP48507 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GCLMP48507 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLMP48507 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GCLMP48507 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GCLMP48507 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GCLMP48507 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GCLMP48507 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCLMP48507 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCLMP48507 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCLMP48507 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GCLMP48507 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GCLMP48507 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GCLMP48507 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCLMP48507 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GCLMP48507 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCLMP48507 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCLMP48507 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GCLMP48507 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCLMP48507 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GCLMP48507 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GCLMP48507 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCLMP48507 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCLMP48507 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCLMP48507 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GCLMP48507 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCLMP48507 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCLMP48507 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GCLMP48507 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCLMP48507 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCLMP48507 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCLMP48507 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GCLMP48507 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLMP48507 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GCLMP48507 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCLMP48507 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GCLMP48507 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms