Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GRIA2P42262 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GRIA2P42262 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GRIA2P42262 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GRIA2P42262 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GRIA2P42262 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms