Protein–RNA interactions for Protein: P40429

RPL13A, 60S ribosomal protein L13a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP40429 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPL13AP40429 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RPL13AP40429 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPL13AP40429 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPL13AP40429 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms