Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ATP7BP35670 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ATP7BP35670 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
ATP7BP35670 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
ATP7BP35670 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
ATP7BP35670 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATP7BP35670 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7BP35670 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms