Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN2P35609 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACTN2P35609 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ACTN2P35609 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ACTN2P35609 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ACTN2P35609 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ACTN2P35609 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms