Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGS2P35354 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGS2P35354 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGS2P35354 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGS2P35354 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGS2P35354 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGS2P35354 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGS2P35354 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGS2P35354 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGS2P35354 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGS2P35354 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms