Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHRNA3P32297 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHRNA3P32297 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHRNA3P32297 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHRNA3P32297 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms