Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXC12P31275 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC12P31275 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXC12P31275 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXC12P31275 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms