Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC25CP30307 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC25CP30307 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25CP30307 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDC25CP30307 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC25CP30307 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC25CP30307 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC25CP30307 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDC25CP30307 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms