Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DUSP1P28562 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP1P28562 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DUSP1P28562 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUSP1P28562 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms