Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.82■■■■□ 3
CANXP27824 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CANXP27824 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CANXP27824 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CANXP27824 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CANXP27824 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CANXP27824 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CANXP27824 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CANXP27824 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CANXP27824 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CANXP27824 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CANXP27824 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CANXP27824 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CANXP27824 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CANXP27824 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CANXP27824 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CANXP27824 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CANXP27824 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CANXP27824 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CANXP27824 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CANXP27824 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CANXP27824 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CANXP27824 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CANXP27824 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CANXP27824 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CANXP27824 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CANXP27824 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CANXP27824 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CANXP27824 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CANXP27824 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CANXP27824 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CANXP27824 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CANXP27824 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CANXP27824 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CANXP27824 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CANXP27824 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CANXP27824 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CANXP27824 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CANXP27824 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CANXP27824 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CANXP27824 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CANXP27824 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CANXP27824 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CANXP27824 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CANXP27824 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CANXP27824 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CANXP27824 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CANXP27824 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CANXP27824 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CANXP27824 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CANXP27824 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CANXP27824 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CANXP27824 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CANXP27824 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CANXP27824 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CANXP27824 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CANXP27824 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CANXP27824 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CANXP27824 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CANXP27824 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CANXP27824 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CANXP27824 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CANXP27824 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CANXP27824 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CANXP27824 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CANXP27824 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CANXP27824 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CANXP27824 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CANXP27824 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CANXP27824 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CANXP27824 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CANXP27824 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CANXP27824 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CANXP27824 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CANXP27824 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CANXP27824 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CANXP27824 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CANXP27824 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CANXP27824 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CANXP27824 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CANXP27824 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CANXP27824 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CANXP27824 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CANXP27824 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CANXP27824 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CANXP27824 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CANXP27824 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
CANXP27824 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CANXP27824 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms