Protein–RNA interactions for Protein: P25942

CD40, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 5, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40P25942 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD40P25942 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD40P25942 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD40P25942 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD40P25942 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD40P25942 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD40P25942 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD40P25942 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD40P25942 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD40P25942 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD40P25942 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CD40P25942 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD40P25942 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD40P25942 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD40P25942 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD40P25942 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD40P25942 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD40P25942 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD40P25942 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD40P25942 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD40P25942 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD40P25942 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD40P25942 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD40P25942 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40P25942 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40P25942 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40P25942 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40P25942 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD40P25942 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD40P25942 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD40P25942 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD40P25942 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD40P25942 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40P25942 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40P25942 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40P25942 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40P25942 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40P25942 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40P25942 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40P25942 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD40P25942 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD40P25942 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD40P25942 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD40P25942 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD40P25942 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD40P25942 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD40P25942 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD40P25942 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD40P25942 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD40P25942 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD40P25942 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD40P25942 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD40P25942 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD40P25942 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD40P25942 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD40P25942 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD40P25942 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD40P25942 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD40P25942 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD40P25942 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD40P25942 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CD40P25942 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD40P25942 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD40P25942 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD40P25942 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD40P25942 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40P25942 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40P25942 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD40P25942 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40P25942 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40P25942 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40P25942 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40P25942 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40P25942 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40P25942 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD40P25942 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms