Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM3P25205 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM3P25205 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM3P25205 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MCM3P25205 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM3P25205 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM3P25205 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM3P25205 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MCM3P25205 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MCM3P25205 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM3P25205 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM3P25205 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MCM3P25205 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCM3P25205 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MCM3P25205 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MCM3P25205 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM3P25205 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM3P25205 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM3P25205 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM3P25205 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MCM3P25205 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3P25205 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3P25205 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3P25205 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3P25205 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MCM3P25205 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3P25205 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3P25205 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MCM3P25205 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3P25205 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3P25205 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3P25205 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MCM3P25205 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3P25205 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3P25205 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3P25205 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3P25205 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3P25205 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3P25205 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MCM3P25205 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3P25205 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCM3P25205 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM3P25205 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM3P25205 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM3P25205 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCM3P25205 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCM3P25205 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3P25205 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3P25205 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3P25205 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCM3P25205 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM3P25205 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCM3P25205 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM3P25205 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCM3P25205 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM3P25205 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM3P25205 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCM3P25205 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM3P25205 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM3P25205 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM3P25205 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM3P25205 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCM3P25205 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM3P25205 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCM3P25205 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM3P25205 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM3P25205 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM3P25205 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM3P25205 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCM3P25205 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM3P25205 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM3P25205 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM3P25205 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCM3P25205 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM3P25205 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM3P25205 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCM3P25205 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCM3P25205 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCM3P25205 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM3P25205 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCM3P25205 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM3P25205 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCM3P25205 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM3P25205 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM3P25205 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM3P25205 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM3P25205 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCM3P25205 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
MCM3P25205 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCM3P25205 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCM3P25205 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCM3P25205 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM3P25205 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM3P25205 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM3P25205 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM3P25205 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM3P25205 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MCM3P25205 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MCM3P25205 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MCM3P25205 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms