Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PAX3P23760 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAX3P23760 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAX3P23760 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAX3P23760 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAX3P23760 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAX3P23760 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PAX3P23760 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PAX3P23760 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PAX3P23760 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAX3P23760 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAX3P23760 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PAX3P23760 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAX3P23760 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAX3P23760 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAX3P23760 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAX3P23760 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAX3P23760 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAX3P23760 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAX3P23760 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PAX3P23760 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAX3P23760 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PAX3P23760 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PAX3P23760 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAX3P23760 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PAX3P23760 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PAX3P23760 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAX3P23760 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAX3P23760 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PAX3P23760 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAX3P23760 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PAX3P23760 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAX3P23760 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAX3P23760 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAX3P23760 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PAX3P23760 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PAX3P23760 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAX3P23760 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAX3P23760 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAX3P23760 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PAX3P23760 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAX3P23760 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PAX3P23760 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PAX3P23760 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PAX3P23760 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAX3P23760 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAX3P23760 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAX3P23760 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAX3P23760 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PAX3P23760 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PAX3P23760 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PAX3P23760 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PAX3P23760 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAX3P23760 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAX3P23760 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PAX3P23760 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAX3P23760 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAX3P23760 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAX3P23760 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAX3P23760 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PAX3P23760 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAX3P23760 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PAX3P23760 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAX3P23760 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAX3P23760 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAX3P23760 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PAX3P23760 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAX3P23760 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAX3P23760 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAX3P23760 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAX3P23760 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PAX3P23760 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PAX3P23760 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PAX3P23760 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAX3P23760 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAX3P23760 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAX3P23760 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAX3P23760 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PAX3P23760 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PAX3P23760 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAX3P23760 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAX3P23760 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAX3P23760 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAX3P23760 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAX3P23760 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAX3P23760 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAX3P23760 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAX3P23760 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAX3P23760 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms