Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CA4P22748 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CA4P22748 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CA4P22748 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CA4P22748 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CA4P22748 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CA4P22748 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CA4P22748 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CA4P22748 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CA4P22748 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CA4P22748 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CA4P22748 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CA4P22748 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CA4P22748 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CA4P22748 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CA4P22748 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CA4P22748 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CA4P22748 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CA4P22748 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CA4P22748 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CA4P22748 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CA4P22748 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CA4P22748 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CA4P22748 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CA4P22748 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CA4P22748 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CA4P22748 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CA4P22748 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CA4P22748 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CA4P22748 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CA4P22748 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CA4P22748 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CA4P22748 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CA4P22748 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CA4P22748 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CA4P22748 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CA4P22748 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CA4P22748 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CA4P22748 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CA4P22748 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CA4P22748 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CA4P22748 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CA4P22748 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CA4P22748 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CA4P22748 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CA4P22748 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CA4P22748 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CA4P22748 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CA4P22748 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CA4P22748 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CA4P22748 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CA4P22748 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CA4P22748 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CA4P22748 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CA4P22748 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CA4P22748 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CA4P22748 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CA4P22748 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CA4P22748 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CA4P22748 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CA4P22748 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CA4P22748 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CA4P22748 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CA4P22748 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CA4P22748 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CA4P22748 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CA4P22748 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CA4P22748 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CA4P22748 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CA4P22748 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CA4P22748 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CA4P22748 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CA4P22748 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CA4P22748 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CA4P22748 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CA4P22748 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CA4P22748 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CA4P22748 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CA4P22748 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CA4P22748 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CA4P22748 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CA4P22748 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CA4P22748 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CA4P22748 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CA4P22748 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CA4P22748 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CA4P22748 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CA4P22748 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CA4P22748 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CA4P22748 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CA4P22748 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CA4P22748 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CA4P22748 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CA4P22748 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CA4P22748 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CA4P22748 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CA4P22748 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CA4P22748 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CA4P22748 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CA4P22748 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms