Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH3P22223 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH3P22223 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH3P22223 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH3P22223 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH3P22223 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH3P22223 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH3P22223 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH3P22223 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH3P22223 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH3P22223 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH3P22223 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH3P22223 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH3P22223 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH3P22223 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH3P22223 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH3P22223 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH3P22223 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH3P22223 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH3P22223 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH3P22223 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH3P22223 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH3P22223 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH3P22223 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH3P22223 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH3P22223 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH3P22223 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH3P22223 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH3P22223 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH3P22223 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH3P22223 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH3P22223 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH3P22223 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDH3P22223 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH3P22223 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH3P22223 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH3P22223 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH3P22223 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH3P22223 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH3P22223 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH3P22223 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH3P22223 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDH3P22223 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH3P22223 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDH3P22223 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH3P22223 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH3P22223 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH3P22223 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH3P22223 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH3P22223 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH3P22223 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH3P22223 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH3P22223 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH3P22223 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH3P22223 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH3P22223 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH3P22223 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH3P22223 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH3P22223 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH3P22223 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH3P22223 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH3P22223 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH3P22223 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH3P22223 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH3P22223 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH3P22223 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH3P22223 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH3P22223 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH3P22223 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH3P22223 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH3P22223 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH3P22223 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH3P22223 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH3P22223 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH3P22223 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH3P22223 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH3P22223 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH3P22223 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH3P22223 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH3P22223 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH3P22223 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH3P22223 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH3P22223 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH3P22223 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH3P22223 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH3P22223 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH3P22223 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH3P22223 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH3P22223 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH3P22223 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH3P22223 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH3P22223 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH3P22223 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH3P22223 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH3P22223 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH3P22223 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH3P22223 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH3P22223 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH3P22223 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH3P22223 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms