Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ERBB3P21860 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ERBB3P21860 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERBB3P21860 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERBB3P21860 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERBB3P21860 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERBB3P21860 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERBB3P21860 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERBB3P21860 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERBB3P21860 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERBB3P21860 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERBB3P21860 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERBB3P21860 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
ERBB3P21860 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ERBB3P21860 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms