Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1D1P20393 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NR1D1P20393 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1D1P20393 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NR1D1P20393 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1D1P20393 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms