Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB3BP20337 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB3BP20337 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB3BP20337 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB3BP20337 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB3BP20337 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms