Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FLT1P17948 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FLT1P17948 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
FLT1P17948 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FLT1P17948 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FLT1P17948 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
FLT1P17948 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FLT1P17948 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FLT1P17948 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FLT1P17948 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FLT1P17948 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
FLT1P17948 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FLT1P17948 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FLT1P17948 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FLT1P17948 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FLT1P17948 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FLT1P17948 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FLT1P17948 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FLT1P17948 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FLT1P17948 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FLT1P17948 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FLT1P17948 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FLT1P17948 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FLT1P17948 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FLT1P17948 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FLT1P17948 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FLT1P17948 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
FLT1P17948 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FLT1P17948 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FLT1P17948 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FLT1P17948 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FLT1P17948 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FLT1P17948 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FLT1P17948 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FLT1P17948 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FLT1P17948 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FLT1P17948 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FLT1P17948 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FLT1P17948 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FLT1P17948 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FLT1P17948 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FLT1P17948 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FLT1P17948 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FLT1P17948 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FLT1P17948 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FLT1P17948 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FLT1P17948 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
FLT1P17948 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FLT1P17948 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FLT1P17948 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FLT1P17948 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FLT1P17948 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FLT1P17948 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FLT1P17948 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FLT1P17948 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FLT1P17948 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
FLT1P17948 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FLT1P17948 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FLT1P17948 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FLT1P17948 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FLT1P17948 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
FLT1P17948 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FLT1P17948 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FLT1P17948 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FLT1P17948 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FLT1P17948 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
FLT1P17948 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FLT1P17948 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FLT1P17948 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FLT1P17948 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
FLT1P17948 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FLT1P17948 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FLT1P17948 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FLT1P17948 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FLT1P17948 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FLT1P17948 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FLT1P17948 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FLT1P17948 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FLT1P17948 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
FLT1P17948 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FLT1P17948 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FLT1P17948 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FLT1P17948 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FLT1P17948 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FLT1P17948 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FLT1P17948 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FLT1P17948 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FLT1P17948 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FLT1P17948 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FLT1P17948 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FLT1P17948 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FLT1P17948 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FLT1P17948 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FLT1P17948 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FLT1P17948 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FLT1P17948 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FLT1P17948 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FLT1P17948 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FLT1P17948 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FLT1P17948 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms