Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA1P17302 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJA1P17302 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA1P17302 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA1P17302 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA1P17302 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA1P17302 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA1P17302 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA1P17302 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA1P17302 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA1P17302 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA1P17302 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA1P17302 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA1P17302 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA1P17302 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA1P17302 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA1P17302 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA1P17302 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA1P17302 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA1P17302 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA1P17302 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA1P17302 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA1P17302 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJA1P17302 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJA1P17302 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA1P17302 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA1P17302 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA1P17302 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA1P17302 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA1P17302 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA1P17302 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA1P17302 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA1P17302 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA1P17302 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA1P17302 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA1P17302 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA1P17302 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA1P17302 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA1P17302 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA1P17302 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA1P17302 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA1P17302 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA1P17302 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA1P17302 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA1P17302 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJA1P17302 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA1P17302 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA1P17302 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA1P17302 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GJA1P17302 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA1P17302 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJA1P17302 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA1P17302 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJA1P17302 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA1P17302 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA1P17302 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA1P17302 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA1P17302 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA1P17302 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA1P17302 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJA1P17302 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA1P17302 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA1P17302 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA1P17302 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA1P17302 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJA1P17302 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJA1P17302 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GJA1P17302 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GJA1P17302 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA1P17302 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GJA1P17302 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA1P17302 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA1P17302 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA1P17302 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA1P17302 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA1P17302 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GJA1P17302 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA1P17302 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA1P17302 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA1P17302 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GJA1P17302 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA1P17302 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA1P17302 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA1P17302 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GJA1P17302 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA1P17302 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA1P17302 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA1P17302 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA1P17302 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GJA1P17302 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA1P17302 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA1P17302 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GJA1P17302 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GJA1P17302 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA1P17302 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA1P17302 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GJA1P17302 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA1P17302 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GJA1P17302 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GJA1P17302 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms