Protein–RNA interactions for Protein: P17040

ZSCAN20, Zinc finger and SCAN domain-containing protein 20, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSCAN20P17040 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZSCAN20P17040 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZSCAN20P17040 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZSCAN20P17040 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZSCAN20P17040 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZSCAN20P17040 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms