Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
STMN1P16949 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STMN1P16949 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
STMN1P16949 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STMN1P16949 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
STMN1P16949 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
STMN1P16949 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STMN1P16949 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STMN1P16949 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
STMN1P16949 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STMN1P16949 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STMN1P16949 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STMN1P16949 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
STMN1P16949 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
STMN1P16949 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STMN1P16949 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STMN1P16949 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
STMN1P16949 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STMN1P16949 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STMN1P16949 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
STMN1P16949 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
STMN1P16949 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
STMN1P16949 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
STMN1P16949 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
STMN1P16949 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
STMN1P16949 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STMN1P16949 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
STMN1P16949 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STMN1P16949 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STMN1P16949 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
STMN1P16949 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
STMN1P16949 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STMN1P16949 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
STMN1P16949 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STMN1P16949 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
STMN1P16949 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
STMN1P16949 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STMN1P16949 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
STMN1P16949 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
STMN1P16949 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
STMN1P16949 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STMN1P16949 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
STMN1P16949 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STMN1P16949 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
STMN1P16949 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
STMN1P16949 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STMN1P16949 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STMN1P16949 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STMN1P16949 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
STMN1P16949 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
STMN1P16949 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STMN1P16949 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
STMN1P16949 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STMN1P16949 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STMN1P16949 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
STMN1P16949 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STMN1P16949 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STMN1P16949 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
STMN1P16949 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
STMN1P16949 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STMN1P16949 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STMN1P16949 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STMN1P16949 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STMN1P16949 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STMN1P16949 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STMN1P16949 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STMN1P16949 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STMN1P16949 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STMN1P16949 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STMN1P16949 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STMN1P16949 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STMN1P16949 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STMN1P16949 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STMN1P16949 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STMN1P16949 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STMN1P16949 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STMN1P16949 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STMN1P16949 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STMN1P16949 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STMN1P16949 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STMN1P16949 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STMN1P16949 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STMN1P16949 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STMN1P16949 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STMN1P16949 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STMN1P16949 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STMN1P16949 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STMN1P16949 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
STMN1P16949 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
STMN1P16949 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
STMN1P16949 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STMN1P16949 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
STMN1P16949 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
STMN1P16949 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STMN1P16949 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
STMN1P16949 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STMN1P16949 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
STMN1P16949 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
STMN1P16949 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
STMN1P16949 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms