Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFRAP16234 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PDGFRAP16234 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDGFRAP16234 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDGFRAP16234 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms