Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF3P15923 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF3P15923 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF3P15923 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF3P15923 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF3P15923 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF3P15923 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF3P15923 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF3P15923 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF3P15923 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF3P15923 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TCF3P15923 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCF3P15923 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TCF3P15923 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TCF3P15923 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCF3P15923 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCF3P15923 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF3P15923 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF3P15923 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF3P15923 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCF3P15923 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCF3P15923 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCF3P15923 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCF3P15923 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCF3P15923 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCF3P15923 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCF3P15923 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCF3P15923 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCF3P15923 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCF3P15923 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TCF3P15923 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCF3P15923 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF3P15923 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF3P15923 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF3P15923 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF3P15923 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF3P15923 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF3P15923 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF3P15923 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF3P15923 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF3P15923 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF3P15923 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF3P15923 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF3P15923 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF3P15923 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF3P15923 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF3P15923 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF3P15923 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF3P15923 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF3P15923 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF3P15923 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF3P15923 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF3P15923 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF3P15923 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF3P15923 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF3P15923 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF3P15923 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF3P15923 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF3P15923 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF3P15923 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF3P15923 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF3P15923 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF3P15923 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF3P15923 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF3P15923 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF3P15923 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF3P15923 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF3P15923 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF3P15923 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF3P15923 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF3P15923 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF3P15923 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF3P15923 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF3P15923 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF3P15923 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF3P15923 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF3P15923 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF3P15923 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF3P15923 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF3P15923 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF3P15923 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF3P15923 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF3P15923 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF3P15923 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TCF3P15923 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCF3P15923 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCF3P15923 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TCF3P15923 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF3P15923 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF3P15923 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF3P15923 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF3P15923 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF3P15923 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TCF3P15923 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF3P15923 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF3P15923 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TCF3P15923 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF3P15923 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF3P15923 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TCF3P15923 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms