Protein–RNA interactions for Protein: P14209

CD99, CD99 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99P14209 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD99P14209 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD99P14209 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD99P14209 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD99P14209 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD99P14209 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD99P14209 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD99P14209 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD99P14209 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD99P14209 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD99P14209 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CD99P14209 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD99P14209 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD99P14209 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD99P14209 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD99P14209 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD99P14209 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD99P14209 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD99P14209 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD99P14209 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD99P14209 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD99P14209 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD99P14209 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD99P14209 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD99P14209 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD99P14209 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD99P14209 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD99P14209 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD99P14209 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD99P14209 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD99P14209 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD99P14209 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD99P14209 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD99P14209 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD99P14209 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD99P14209 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD99P14209 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD99P14209 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD99P14209 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD99P14209 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD99P14209 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD99P14209 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD99P14209 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CD99P14209 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD99P14209 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD99P14209 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD99P14209 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD99P14209 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD99P14209 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD99P14209 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD99P14209 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD99P14209 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD99P14209 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD99P14209 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD99P14209 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD99P14209 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD99P14209 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD99P14209 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD99P14209 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD99P14209 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD99P14209 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD99P14209 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD99P14209 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD99P14209 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD99P14209 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD99P14209 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD99P14209 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD99P14209 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD99P14209 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD99P14209 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD99P14209 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD99P14209 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD99P14209 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD99P14209 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD99P14209 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD99P14209 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD99P14209 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD99P14209 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CD99P14209 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD99P14209 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD99P14209 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD99P14209 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CD99P14209 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CD99P14209 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD99P14209 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CD99P14209 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CD99P14209 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD99P14209 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD99P14209 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CD99P14209 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD99P14209 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD99P14209 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD99P14209 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD99P14209 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD99P14209 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD99P14209 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD99P14209 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD99P14209 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CD99P14209 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CD99P14209 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms