Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTHFD2P13995 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTHFD2P13995 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTHFD2P13995 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MTHFD2P13995 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD2P13995 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms