Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC130P13994 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC130P13994 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC130P13994 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC130P13994 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms