Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SKIP12755 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIP12755 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIP12755 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SKIP12755 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SKIP12755 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKIP12755 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SKIP12755 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKIP12755 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKIP12755 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SKIP12755 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKIP12755 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SKIP12755 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKIP12755 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKIP12755 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SKIP12755 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SKIP12755 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SKIP12755 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SKIP12755 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SKIP12755 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SKIP12755 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SKIP12755 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SKIP12755 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKIP12755 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKIP12755 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKIP12755 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKIP12755 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SKIP12755 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SKIP12755 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIP12755 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIP12755 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SKIP12755 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SKIP12755 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKIP12755 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SKIP12755 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKIP12755 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SKIP12755 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKIP12755 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SKIP12755 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SKIP12755 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKIP12755 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SKIP12755 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SKIP12755 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKIP12755 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKIP12755 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKIP12755 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SKIP12755 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKIP12755 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SKIP12755 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKIP12755 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SKIP12755 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIP12755 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIP12755 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIP12755 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIP12755 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIP12755 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIP12755 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIP12755 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIP12755 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SKIP12755 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKIP12755 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKIP12755 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKIP12755 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SKIP12755 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKIP12755 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKIP12755 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKIP12755 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKIP12755 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SKIP12755 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKIP12755 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKIP12755 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKIP12755 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SKIP12755 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIP12755 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIP12755 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIP12755 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIP12755 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIP12755 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIP12755 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIP12755 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SKIP12755 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKIP12755 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKIP12755 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKIP12755 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKIP12755 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SKIP12755 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIP12755 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIP12755 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIP12755 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIP12755 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIP12755 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIP12755 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIP12755 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIP12755 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SKIP12755 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKIP12755 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKIP12755 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKIP12755 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SKIP12755 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SKIP12755 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms