Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MS4A1P11836 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
MS4A1P11836 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MS4A1P11836 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
MS4A1P11836 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MS4A1P11836 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms