Protein–RNA interactions for Protein: P11172

UMPS, Uridine 5'-monophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMPSP11172 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UMPSP11172 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UMPSP11172 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UMPSP11172 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UMPSP11172 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UMPSP11172 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UMPSP11172 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UMPSP11172 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UMPSP11172 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UMPSP11172 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UMPSP11172 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UMPSP11172 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UMPSP11172 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
UMPSP11172 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UMPSP11172 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UMPSP11172 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UMPSP11172 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMPSP11172 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMPSP11172 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMPSP11172 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMPSP11172 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMPSP11172 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMPSP11172 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMPSP11172 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UMPSP11172 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UMPSP11172 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UMPSP11172 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UMPSP11172 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UMPSP11172 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UMPSP11172 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UMPSP11172 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UMPSP11172 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UMPSP11172 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UMPSP11172 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UMPSP11172 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UMPSP11172 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UMPSP11172 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UMPSP11172 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UMPSP11172 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UMPSP11172 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UMPSP11172 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UMPSP11172 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UMPSP11172 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UMPSP11172 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UMPSP11172 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UMPSP11172 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UMPSP11172 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UMPSP11172 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UMPSP11172 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UMPSP11172 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UMPSP11172 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UMPSP11172 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UMPSP11172 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UMPSP11172 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UMPSP11172 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMPSP11172 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMPSP11172 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMPSP11172 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMPSP11172 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMPSP11172 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UMPSP11172 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UMPSP11172 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UMPSP11172 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UMPSP11172 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UMPSP11172 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UMPSP11172 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UMPSP11172 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UMPSP11172 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UMPSP11172 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UMPSP11172 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UMPSP11172 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UMPSP11172 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UMPSP11172 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UMPSP11172 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UMPSP11172 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UMPSP11172 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UMPSP11172 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UMPSP11172 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UMPSP11172 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UMPSP11172 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMPSP11172 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMPSP11172 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMPSP11172 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMPSP11172 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMPSP11172 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UMPSP11172 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UMPSP11172 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UMPSP11172 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UMPSP11172 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UMPSP11172 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms