Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LAMC1P11047 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LAMC1P11047 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
LAMC1P11047 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.78■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
LAMC1P11047 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
LAMC1P11047 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
LAMC1P11047 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
LAMC1P11047 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
LAMC1P11047 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
LAMC1P11047 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
LAMC1P11047 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC1P11047 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC1P11047 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LAMC1P11047 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC1P11047 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
LAMC1P11047 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
LAMC1P11047 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms