Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHGAP10645 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHGAP10645 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHGAP10645 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CHGAP10645 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHGAP10645 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHGAP10645 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHGAP10645 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CHGAP10645 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHGAP10645 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHGAP10645 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHGAP10645 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHGAP10645 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHGAP10645 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHGAP10645 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHGAP10645 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHGAP10645 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHGAP10645 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHGAP10645 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHGAP10645 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHGAP10645 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CHGAP10645 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHGAP10645 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHGAP10645 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHGAP10645 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHGAP10645 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHGAP10645 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHGAP10645 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHGAP10645 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHGAP10645 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHGAP10645 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHGAP10645 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHGAP10645 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CHGAP10645 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHGAP10645 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CHGAP10645 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CHGAP10645 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHGAP10645 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CHGAP10645 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHGAP10645 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CHGAP10645 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
CHGAP10645 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CHGAP10645 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CHGAP10645 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CHGAP10645 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHGAP10645 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHGAP10645 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CHGAP10645 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CHGAP10645 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CHGAP10645 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CHGAP10645 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CHGAP10645 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
CHGAP10645 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CHGAP10645 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CHGAP10645 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CHGAP10645 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHGAP10645 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHGAP10645 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CHGAP10645 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CHGAP10645 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CHGAP10645 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CHGAP10645 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CHGAP10645 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CHGAP10645 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CHGAP10645 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CHGAP10645 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CHGAP10645 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
CHGAP10645 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
CHGAP10645 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CHGAP10645 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHGAP10645 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHGAP10645 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
CHGAP10645 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHGAP10645 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHGAP10645 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CHGAP10645 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHGAP10645 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHGAP10645 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHGAP10645 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CHGAP10645 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHGAP10645 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHGAP10645 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
CHGAP10645 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
CHGAP10645 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
CHGAP10645 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHGAP10645 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
CHGAP10645 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHGAP10645 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CHGAP10645 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CHGAP10645 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
CHGAP10645 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHGAP10645 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CHGAP10645 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHGAP10645 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CHGAP10645 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHGAP10645 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHGAP10645 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHGAP10645 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
CHGAP10645 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
CHGAP10645 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms