Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD7

PGA4, Pepsin A-4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA4P0DJD7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGA4P0DJD7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PGA4P0DJD7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PGA4P0DJD7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PGA4P0DJD7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGA4P0DJD7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PGA4P0DJD7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGA4P0DJD7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PGA4P0DJD7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms