Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC2BP0DI82 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2BP0DI82 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRAPPC2BP0DI82 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRAPPC2BP0DI82 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms