Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
MMP10P09238 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
MMP10P09238 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
MMP10P09238 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
MMP10P09238 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
MMP10P09238 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MMP10P09238 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MMP10P09238 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MMP10P09238 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MMP10P09238 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
MMP10P09238 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
MMP10P09238 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MMP10P09238 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MMP10P09238 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MMP10P09238 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MMP10P09238 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MMP10P09238 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MMP10P09238 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MMP10P09238 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
MMP10P09238 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MMP10P09238 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MMP10P09238 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
MMP10P09238 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MMP10P09238 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
MMP10P09238 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
MMP10P09238 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MMP10P09238 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MMP10P09238 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MMP10P09238 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
MMP10P09238 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MMP10P09238 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
MMP10P09238 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MMP10P09238 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MMP10P09238 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MMP10P09238 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MMP10P09238 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MMP10P09238 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
MMP10P09238 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MMP10P09238 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
MMP10P09238 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
MMP10P09238 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MMP10P09238 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
MMP10P09238 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MMP10P09238 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MMP10P09238 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
MMP10P09238 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MMP10P09238 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MMP10P09238 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MMP10P09238 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MMP10P09238 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
MMP10P09238 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MMP10P09238 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
MMP10P09238 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MMP10P09238 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
MMP10P09238 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
MMP10P09238 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MMP10P09238 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MMP10P09238 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
MMP10P09238 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
MMP10P09238 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MMP10P09238 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MMP10P09238 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
MMP10P09238 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MMP10P09238 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MMP10P09238 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MMP10P09238 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
MMP10P09238 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
MMP10P09238 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
MMP10P09238 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
MMP10P09238 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MMP10P09238 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MMP10P09238 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MMP10P09238 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MMP10P09238 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
MMP10P09238 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MMP10P09238 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MMP10P09238 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MMP10P09238 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MMP10P09238 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MMP10P09238 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MMP10P09238 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MMP10P09238 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MMP10P09238 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MMP10P09238 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
MMP10P09238 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MMP10P09238 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MMP10P09238 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MMP10P09238 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
MMP10P09238 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MMP10P09238 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
MMP10P09238 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MMP10P09238 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MMP10P09238 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MMP10P09238 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MMP10P09238 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MMP10P09238 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MMP10P09238 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MMP10P09238 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MMP10P09238 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MMP10P09238 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms