Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APODP05090 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APODP05090 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APODP05090 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APODP05090 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
APODP05090 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APODP05090 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APODP05090 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APODP05090 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APODP05090 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
APODP05090 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APODP05090 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APODP05090 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APODP05090 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APODP05090 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APODP05090 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APODP05090 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
APODP05090 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APODP05090 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
APODP05090 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APODP05090 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APODP05090 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APODP05090 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APODP05090 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APODP05090 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APODP05090 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APODP05090 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APODP05090 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
APODP05090 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APODP05090 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APODP05090 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APODP05090 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APODP05090 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APODP05090 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
APODP05090 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APODP05090 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APODP05090 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APODP05090 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
APODP05090 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APODP05090 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APODP05090 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
APODP05090 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APODP05090 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APODP05090 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APODP05090 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APODP05090 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APODP05090 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APODP05090 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APODP05090 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APODP05090 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APODP05090 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APODP05090 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APODP05090 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APODP05090 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APODP05090 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APODP05090 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APODP05090 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APODP05090 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APODP05090 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APODP05090 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APODP05090 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APODP05090 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APODP05090 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APODP05090 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APODP05090 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APODP05090 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APODP05090 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APODP05090 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APODP05090 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APODP05090 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APODP05090 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APODP05090 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APODP05090 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APODP05090 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APODP05090 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APODP05090 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APODP05090 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APODP05090 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APODP05090 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APODP05090 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APODP05090 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APODP05090 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APODP05090 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APODP05090 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APODP05090 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APODP05090 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APODP05090 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APODP05090 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APODP05090 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APODP05090 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APODP05090 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APODP05090 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APODP05090 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APODP05090 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APODP05090 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APODP05090 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APODP05090 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APODP05090 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APODP05090 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APODP05090 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms