Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ESR1P03372 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ESR1P03372 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ESR1P03372 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ESR1P03372 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ESR1P03372 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ESR1P03372 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ESR1P03372 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESR1P03372 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESR1P03372 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESR1P03372 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESR1P03372 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESR1P03372 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESR1P03372 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESR1P03372 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESR1P03372 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ESR1P03372 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ESR1P03372 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ESR1P03372 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ESR1P03372 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ESR1P03372 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ESR1P03372 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESR1P03372 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESR1P03372 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESR1P03372 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESR1P03372 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESR1P03372 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ESR1P03372 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ESR1P03372 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ESR1P03372 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ESR1P03372 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ESR1P03372 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ESR1P03372 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ESR1P03372 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ESR1P03372 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ESR1P03372 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ESR1P03372 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ESR1P03372 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ESR1P03372 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ESR1P03372 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ESR1P03372 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ESR1P03372 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ESR1P03372 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ESR1P03372 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ESR1P03372 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ESR1P03372 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ESR1P03372 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ESR1P03372 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ESR1P03372 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ESR1P03372 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ESR1P03372 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ESR1P03372 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ESR1P03372 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ESR1P03372 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ESR1P03372 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ESR1P03372 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ESR1P03372 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ESR1P03372 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ESR1P03372 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ESR1P03372 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ESR1P03372 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ESR1P03372 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ESR1P03372 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ESR1P03372 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ESR1P03372 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ESR1P03372 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ESR1P03372 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ESR1P03372 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ESR1P03372 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ESR1P03372 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ESR1P03372 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ESR1P03372 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ESR1P03372 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ESR1P03372 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ESR1P03372 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ESR1P03372 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ESR1P03372 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ESR1P03372 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ESR1P03372 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ESR1P03372 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ESR1P03372 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ESR1P03372 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ESR1P03372 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ESR1P03372 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ESR1P03372 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ESR1P03372 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ESR1P03372 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ESR1P03372 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ESR1P03372 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms