Protein–RNA interactions for Protein: P02787

TF, Serotransferrin, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFP02787 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TFP02787 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFP02787 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFP02787 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TFP02787 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFP02787 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TFP02787 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFP02787 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFP02787 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFP02787 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFP02787 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFP02787 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFP02787 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TFP02787 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFP02787 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFP02787 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TFP02787 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TFP02787 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFP02787 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFP02787 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFP02787 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TFP02787 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFP02787 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFP02787 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TFP02787 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFP02787 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFP02787 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFP02787 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFP02787 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFP02787 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFP02787 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFP02787 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TFP02787 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFP02787 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TFP02787 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFP02787 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFP02787 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TFP02787 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFP02787 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFP02787 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TFP02787 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFP02787 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFP02787 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFP02787 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFP02787 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TFP02787 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TFP02787 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFP02787 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TFP02787 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFP02787 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFP02787 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFP02787 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFP02787 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TFP02787 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFP02787 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TFP02787 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFP02787 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFP02787 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFP02787 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFP02787 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFP02787 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFP02787 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFP02787 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFP02787 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFP02787 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFP02787 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFP02787 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFP02787 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFP02787 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFP02787 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TFP02787 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFP02787 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFP02787 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFP02787 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFP02787 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFP02787 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFP02787 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFP02787 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFP02787 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFP02787 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFP02787 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFP02787 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFP02787 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFP02787 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFP02787 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFP02787 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFP02787 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFP02787 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFP02787 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFP02787 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFP02787 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFP02787 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFP02787 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFP02787 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFP02787 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFP02787 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFP02787 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFP02787 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFP02787 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TFP02787 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms