Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA1P02647 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA1P02647 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOA1P02647 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA1P02647 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA1P02647 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA1P02647 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA1P02647 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOA1P02647 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA1P02647 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA1P02647 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA1P02647 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA1P02647 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA1P02647 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOA1P02647 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA1P02647 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA1P02647 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOA1P02647 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOA1P02647 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA1P02647 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA1P02647 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA1P02647 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOA1P02647 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOA1P02647 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA1P02647 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA1P02647 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA1P02647 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA1P02647 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOA1P02647 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA1P02647 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOA1P02647 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA1P02647 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA1P02647 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA1P02647 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOA1P02647 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA1P02647 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA1P02647 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA1P02647 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA1P02647 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOA1P02647 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA1P02647 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA1P02647 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA1P02647 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA1P02647 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOA1P02647 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA1P02647 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA1P02647 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA1P02647 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA1P02647 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA1P02647 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOA1P02647 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA1P02647 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA1P02647 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOA1P02647 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA1P02647 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA1P02647 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA1P02647 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA1P02647 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOA1P02647 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA1P02647 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA1P02647 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA1P02647 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA1P02647 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA1P02647 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA1P02647 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA1P02647 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA1P02647 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOA1P02647 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA1P02647 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA1P02647 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOA1P02647 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA1P02647 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA1P02647 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOA1P02647 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOA1P02647 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA1P02647 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA1P02647 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA1P02647 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOA1P02647 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA1P02647 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA1P02647 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOA1P02647 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA1P02647 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA1P02647 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOA1P02647 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOA1P02647 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA1P02647 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA1P02647 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA1P02647 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA1P02647 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA1P02647 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA1P02647 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA1P02647 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOA1P02647 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA1P02647 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA1P02647 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA1P02647 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA1P02647 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA1P02647 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOA1P02647 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms