Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHEP01854 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHEP01854 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHEP01854 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHEP01854 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHEP01854 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHEP01854 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHEP01854 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHEP01854 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHEP01854 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHEP01854 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHEP01854 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHEP01854 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHEP01854 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHEP01854 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGHEP01854 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGHEP01854 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGHEP01854 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGHEP01854 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGHEP01854 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGHEP01854 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGHEP01854 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGHEP01854 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGHEP01854 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGHEP01854 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGHEP01854 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHEP01854 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHEP01854 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHEP01854 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHEP01854 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGHEP01854 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGHEP01854 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGHEP01854 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGHEP01854 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGHEP01854 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IGHEP01854 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGHEP01854 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGHEP01854 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGHEP01854 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
IGHEP01854 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGHEP01854 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGHEP01854 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGHEP01854 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGHEP01854 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHEP01854 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHEP01854 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHEP01854 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGHEP01854 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IGHEP01854 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGHEP01854 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHEP01854 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHEP01854 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHEP01854 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHEP01854 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHEP01854 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHEP01854 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHEP01854 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHEP01854 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHEP01854 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHEP01854 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHEP01854 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHEP01854 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHEP01854 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHEP01854 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGHEP01854 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IGHEP01854 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IGHEP01854 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGHEP01854 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGHEP01854 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGHEP01854 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGHEP01854 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGHEP01854 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGHEP01854 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGHEP01854 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGHEP01854 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGHEP01854 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGHEP01854 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGHEP01854 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGHEP01854 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHEP01854 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHEP01854 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHEP01854 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHEP01854 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHEP01854 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHEP01854 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGHEP01854 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IGHEP01854 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGHEP01854 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGHEP01854 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGHEP01854 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms