Protein–RNA interactions for Protein: P01258

CALCA, Calcitonin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCAP01258 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALCAP01258 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CALCAP01258 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CALCAP01258 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CALCAP01258 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CALCAP01258 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALCAP01258 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CALCAP01258 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCAP01258 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCAP01258 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CALCAP01258 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCAP01258 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCAP01258 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCAP01258 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCAP01258 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CALCAP01258 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CALCAP01258 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CALCAP01258 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCAP01258 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCAP01258 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCAP01258 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CALCAP01258 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CALCAP01258 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCAP01258 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCAP01258 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCAP01258 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCAP01258 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CALCAP01258 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CALCAP01258 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCAP01258 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCAP01258 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCAP01258 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCAP01258 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CALCAP01258 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCAP01258 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCAP01258 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CALCAP01258 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCAP01258 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCAP01258 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCAP01258 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CALCAP01258 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CALCAP01258 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCAP01258 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCAP01258 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCAP01258 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCAP01258 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CALCAP01258 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCAP01258 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CALCAP01258 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALCAP01258 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALCAP01258 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CALCAP01258 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CALCAP01258 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CALCAP01258 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALCAP01258 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CALCAP01258 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCAP01258 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCAP01258 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCAP01258 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CALCAP01258 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCAP01258 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCAP01258 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCAP01258 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CALCAP01258 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALCAP01258 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALCAP01258 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CALCAP01258 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCAP01258 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CALCAP01258 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CALCAP01258 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CALCAP01258 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms