Protein–RNA interactions for Protein: O95573

ACSL3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL3O95573 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACSL3O95573 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACSL3O95573 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ACSL3O95573 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ACSL3O95573 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms