Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOL3O95236 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOL3O95236 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOL3O95236 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOL3O95236 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOL3O95236 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOL3O95236 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOL3O95236 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOL3O95236 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
APOL3O95236 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOL3O95236 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOL3O95236 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOL3O95236 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOL3O95236 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOL3O95236 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOL3O95236 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOL3O95236 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOL3O95236 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
APOL3O95236 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOL3O95236 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOL3O95236 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOL3O95236 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOL3O95236 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOL3O95236 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
APOL3O95236 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOL3O95236 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOL3O95236 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOL3O95236 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOL3O95236 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOL3O95236 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOL3O95236 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOL3O95236 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOL3O95236 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOL3O95236 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOL3O95236 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOL3O95236 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOL3O95236 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOL3O95236 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APOL3O95236 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
APOL3O95236 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOL3O95236 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOL3O95236 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOL3O95236 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APOL3O95236 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOL3O95236 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOL3O95236 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOL3O95236 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOL3O95236 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APOL3O95236 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOL3O95236 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOL3O95236 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOL3O95236 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOL3O95236 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOL3O95236 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOL3O95236 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
APOL3O95236 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOL3O95236 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOL3O95236 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOL3O95236 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APOL3O95236 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOL3O95236 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOL3O95236 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOL3O95236 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOL3O95236 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOL3O95236 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOL3O95236 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APOL3O95236 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOL3O95236 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
APOL3O95236 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL3O95236 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL3O95236 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL3O95236 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL3O95236 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL3O95236 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APOL3O95236 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL3O95236 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL3O95236 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL3O95236 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOL3O95236 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL3O95236 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL3O95236 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL3O95236 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL3O95236 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL3O95236 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL3O95236 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOL3O95236 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL3O95236 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL3O95236 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL3O95236 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL3O95236 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL3O95236 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL3O95236 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL3O95236 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL3O95236 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOL3O95236 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL3O95236 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOL3O95236 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL3O95236 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL3O95236 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOL3O95236 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms