Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRMUO75648 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMUO75648 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMUO75648 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMUO75648 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMUO75648 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMUO75648 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMUO75648 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRMUO75648 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMUO75648 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMUO75648 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRMUO75648 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMUO75648 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMUO75648 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMUO75648 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRMUO75648 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMUO75648 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMUO75648 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMUO75648 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMUO75648 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMUO75648 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRMUO75648 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMUO75648 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMUO75648 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMUO75648 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMUO75648 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMUO75648 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMUO75648 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMUO75648 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMUO75648 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRMUO75648 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMUO75648 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMUO75648 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRMUO75648 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMUO75648 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMUO75648 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMUO75648 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMUO75648 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRMUO75648 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMUO75648 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMUO75648 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMUO75648 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMUO75648 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRMUO75648 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMUO75648 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMUO75648 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRMUO75648 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMUO75648 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMUO75648 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRMUO75648 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMUO75648 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMUO75648 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMUO75648 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMUO75648 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMUO75648 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRMUO75648 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMUO75648 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMUO75648 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMUO75648 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMUO75648 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRMUO75648 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMUO75648 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMUO75648 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMUO75648 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRMUO75648 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMUO75648 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMUO75648 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRMUO75648 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMUO75648 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMUO75648 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRMUO75648 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMUO75648 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMUO75648 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMUO75648 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMUO75648 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMUO75648 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMUO75648 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRMUO75648 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMUO75648 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMUO75648 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMUO75648 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMUO75648 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMUO75648 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRMUO75648 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMUO75648 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMUO75648 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMUO75648 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMUO75648 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMUO75648 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRMUO75648 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMUO75648 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMUO75648 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMUO75648 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMUO75648 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMUO75648 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRMUO75648 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMUO75648 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMUO75648 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMUO75648 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRMUO75648 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms