Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH16O75309 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH16O75309 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH16O75309 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH16O75309 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH16O75309 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH16O75309 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH16O75309 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH16O75309 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH16O75309 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH16O75309 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH16O75309 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH16O75309 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH16O75309 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH16O75309 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH16O75309 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH16O75309 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH16O75309 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH16O75309 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH16O75309 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH16O75309 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH16O75309 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH16O75309 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH16O75309 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH16O75309 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH16O75309 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH16O75309 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH16O75309 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH16O75309 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH16O75309 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH16O75309 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH16O75309 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH16O75309 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CDH16O75309 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH16O75309 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH16O75309 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH16O75309 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH16O75309 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDH16O75309 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH16O75309 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH16O75309 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH16O75309 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH16O75309 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH16O75309 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH16O75309 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH16O75309 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH16O75309 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH16O75309 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH16O75309 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH16O75309 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH16O75309 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH16O75309 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH16O75309 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH16O75309 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH16O75309 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH16O75309 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH16O75309 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH16O75309 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH16O75309 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH16O75309 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH16O75309 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH16O75309 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH16O75309 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH16O75309 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH16O75309 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH16O75309 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH16O75309 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH16O75309 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH16O75309 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH16O75309 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH16O75309 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH16O75309 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH16O75309 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH16O75309 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH16O75309 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH16O75309 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH16O75309 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH16O75309 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH16O75309 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH16O75309 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH16O75309 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH16O75309 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH16O75309 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH16O75309 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH16O75309 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH16O75309 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH16O75309 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH16O75309 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDH16O75309 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH16O75309 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH16O75309 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH16O75309 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDH16O75309 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDH16O75309 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH16O75309 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH16O75309 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH16O75309 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH16O75309 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH16O75309 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH16O75309 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms