Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC22O60826 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC22O60826 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC22O60826 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC22O60826 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC22O60826 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms