Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NDUFS5O43920 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS5O43920 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NDUFS5O43920 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NDUFS5O43920 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS5O43920 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS5O43920 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms